侵害计算机软件著作权纠纷处理方式包括调解、仲裁和诉讼。软件著作权涉及软件著作人身权和财产权，其中著作人身权包括发表权、署名权和修改权，著作财产权包括专有使用权、使用许可权和转让权。
法律分析
一、侵害计算机软件著作权纠纷处理方式有哪些？
1、调解
调解达成协议后，一方反悔，不同意按调解协议执行的，调解协议即失去效力，当事人可通过诉讼来解决纠纷。
2、仲裁
著作权仲裁机关所作出的仲裁具有法律上的强制力，一方不履行仲裁裁决的，另一方可以申请人民强制执行。
3、诉讼
诉讼是我国《著作权法》所规定的解决著作权纠纷的主要方式。
二、软件著作权有哪些
(一)软件著作人身权
1、发表权，即决定软件是否公之于众的权利;
2、署名权，即表明开发者身份，在软件上署名的权利;
3、修改权，即对软件进行增补、删节，或者改变指令、语句顺序的权利。
(二)软件著作财产权
1、专有使用权。其具体包括：
(1)复制权，即将软件制作一份或者多份的权利;
(2)发行权，即以出售或者赠与方式向公众提供软件的原件或者复制件的权利;
(3)出租权，即有偿许可他人临时使用软件的权利，但是软件不是出租的主要标的的除外;
(4)信息网络传播权，即以有线或者无线方式向公众提供软件，使公众可以在其个人选定的时间和地点获得软件的权利;
(5)翻译权，即将原软件从一种自然语言文字转换成另一种自然语言文字的权利;
(6)应当由软件著作权人享有的其他专有使用权。
2、使用许可权，即软件著作权人享有的许可他人行使其软件著作权并获得报酬的权利。许可他人行使软件著作权的，应当订立许可使用合同。使用许可分为专有许可或非专有许可。没有订立合同或者合同中没有明确约定为专有许可的，被许可行使的权利应当视为非专有权利。
3、转让权，即软件著作权人享有的全部或者部分转让其软件著作权并获得报酬的权利。转让软件著作权的，当事人应当订立书面合同。
结语
根据上述内容，侵害计算机软件著作权纠纷的处理方式包括调解、仲裁和诉讼。调解需要双方达成协议并执行，如一方反悔可通过诉讼解决。仲裁具有法律上的强制力，一方不履行仲裁裁决可申请强制执行。诉讼是解决著作权纠纷的主要方式。软件著作权包括软件著作人身权和软件著作财产权。软件著作人身权包括发表权、署名权和修改权。软件著作财产权包括专有使用权、使用许可权和转让权。使用许可分为专有和非专有许可，转让软件著作权需订立书面合同。
法律依据
中华人民共和国著作权法（2020修正）：第五章 著作权和与著作权有关的权利的保护 第五十三条 有下列侵权行为的，应当根据情况，承担本法第五十二条规定的民事责任；侵权行为同时损害公共利益的，由主管著作权的部门责令停止侵权行为，予以警告，没收违法所得，没收、无害化销毁处理侵权复制品以及主要用于制作侵权复制品的材料、工具、设备等，违法经营额五万元以上的，可以并处违法经营额一倍以上五倍以下的罚款；没有违法经营额、违法经营额难以计算或者不足五万元的，可以并处二十五万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任：
（一）未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，本法另有规定的除外；
（二）出版他人享有专有出版权的图书的；
（三）未经表演者许可，复制、发行录有其表演的录音录像制品，或者通过信息网络向公众传播其表演的，本法另有规定的除外；
（四）未经录音录像制作者许可，复制、发行、通过信息网络向公众传播其制作的录音录像制品的，本法另有规定的除外；
（五）未经许可，播放、复制或者通过信息网络向公众传播广播、电视的，本法另有规定的除外；
（六）未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意避开或者破坏技术措施的，故意制造、进口或者向他人提供主要用于避开、破坏技术措施的装置或者部件的，或者故意为他人避开或者破坏技术措施提供技术服务的，法律、行规另有规定的除外；
（七）未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意删除或者改变作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息的，知道或者应当知道作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息未经许可被删除或者改变，仍然向公众提供的，法律、行规另有规定的除外；
（八）制作、出售假冒他人署名的作品的。
中华人民共和国著作权法（2020修正）：第五章 著作权和与著作权有关的权利的保护 第五十 人民审理案件，对于侵犯著作权或者与著作权有关的权利的，可以没收违法所得、侵权复制品以及进行违法活动的财物。
中华人民共和国著作权法（2020修正）：第五章 著作权和与著作权有关的权利的保护 第五十九条 复制品的出版者、制作者不能证明其出版、制作有合法授权的，复制品的发行者或者视听作品、计算机软件、录音录像制品的复制品的出租者不能证明其发行、出租的复制品有合法来源的，应当承担法律责任。
在诉讼程序中，被诉侵权人主张其不承担侵权责任的，应当提供证据证明已经取得权利人的许可，或者具有本法规定的不经权利人许可而可以使用的情形。